Bubble Pop Shooter is een bubbelspel. De speler probeert een veld met hangende bubbels leeg te knallen met bubbelprojectielen voordat de rijen naar de onderkant van het scherm glijden.
Het spel voorziet de speler van één projectiel per zet, een miklijn bestaande uit witte streepjes en een bijpassende kleur mikbel met bevestigingsmarkeringen bestaande uit gele mikstreepjes. De speler gebruikt deze hulpmiddelen om twee of meer met elkaar verbonden bellen te raken die overeenkomen met de kleur van het projectiel. De bubbels spatten uiteen met vloeistof. Niet-matchende bubbels vallen en knallen ook.
Hoewel het doel van de speler is om zo vaak mogelijk clusters van dezelfde bubbels te laten knappen, kan hij ook een schot wagen door slechts één overeenkomende bubbel te raken. Er staat de speler echter een zware straf te wachten. Als het na een willekeurig aantal keren niet lukt om clusters te laten knappen, schuift het spel meer rijen van bovenaf op het scherm.
Bubble Pop Shooter vereist precisieschieten. De speler moet zijn doelballon precies op de juiste plek plaatsen en de gele bevestigingstekens in de gaten houden voordat hij een schot lost. Als ze het schot niet goed richten, rolt het projectiel tegen een luchtbel en hecht het zich aan een rij op de verkeerde plek.
